Mediacja znajduje również zastosowanie w postępowaniach przed organami administracji publicznej oraz sądami administracyjnymi.

Możliwe jest prowadzenie mediacji administracyjnej zarówno między stronami a organem administracji, jak i między uczestnikami postępowania administracyjnego.

Mediacje administracyjne prowadzone są z inicjatywny organu, sądu administracyjnego lub strony postępowania, a uczestnicy mediacji mają prawo wyboru mediatora.

Mediacje w sprawach administracyjnych prowadzone są z poszanowaniem najważniejszych zasad mediacji: dobrowolności i poufności mediacji oraz obowiązku bezstronności mediatora.

Celem mediacji prowadzonych w sprawach administracyjnych jest wyjaśnienie i rozważenie okoliczności faktycznych i prawnych sprawy oraz przyjęcie ustaleń co do sposobu jej załatwienia w granicach obowiązującego prawa, poprzez zawarcie ugody lub wydanie decyzji administracyjnej.

Mediacje administracyjne są prowadzone najczęściej w sprawach z zakresu prawa budowlanego, zagospodarowania przestrzennego, a także ustalenia środowiskowych uwarunkowań realizacji przedsięwzięcia. Są szczególnie pomocne przy sprawach dotyczących dużych inwestycji prowadzonych przy udziale wielu podmiotów o różnych interesach, które wymagają uzgodnienia.